Erbaut in der zweiten Hälfte des 15. Jahrhunderts durch Faik Pascha. Diese Moschee wurde aus dem Material der alten byzantinischen Kirche Parigoritissa im antiken Nikolopolis und verschiedener antiker Gebäude in Amvrakia errichtet.
Faik Pascha baute das Imaret (Armenhaus), wo zahlreiche mittellose Bewohner Unterkunft und Verpflegung fanden, um seinen Namen zu verewigen. Das Viertel wurde nach dem Imaret „Marati“ genannt.
Die Moschee wurde 1821 Schauplatz der Revolutionskämpfe.
Laut Ioannis Makrygiannis verschanzte sich am 14. November 1821 Markos Botsaris mit seinen 300 Männern in dieser Moschee. Zahlreiche Partisanenführer, darunter Georgios Karaiskakis, schlugen sich auf seine Seite.
Am 15. begannen die Türken einen ununterbrochenen Beschuss mit Kanonen, der bedeutende Verluste mit sich brachte. Botsaris und Karaiskakis verbarrikadierten sich in der Moschee, bis Notis Botsaris mit 300 Männern zu Hilfe eilte. Gemeinsam schlugen sie die Türken bis nach Arta zurück.
Nach der Befreiung Arta wurde die Moschee zu einer Kirche umgebaut, die man dem heiligen Ioannis Rossos weihte.