Innerhalb der frühchristlichen Mauern wurden insgesamt vier Basiliken entdeckt und teilweise ausgegraben.
Die Basilika II Alkisonos, die Metropolis von Nikolopolis, befindet sich im nordöstlichen Teil der Stadt und stammt aus der Mitte des 5. Jahrhunderts.
An diese große fünfschiffige Basilika sind im Südwesten Hilfsräume angebaut, während im westlichen Teil ein Denkmal-Säulengang erbaut wurde. Ungefähr in der Mitte des Mittelschiffs ist die Kanzel teilweise erhalten.
Ein charakteristisches Merkmal der Innenausstattung der Basilika sind die architektonischen Reliefs, während es sich beim größten Teil um Spolien römischer Monumente handelt.
Die Böden sind mit verschiedenen Marmormotiven geschmückt, während die Böden im Narthex, dem Innenhof mit den drei Säulengängen und den Vorgebäuden mit Mosaik ausgelegt sind.