Es befindet sich am Nordrand der Stadt und wurde 2009 für das Publikum eröffnet.
Ausgestellt sind Funde aus den Ausgrabungen in der weiteren Gegend von Thesprotia von der Mittelsteinzeit (100.000 v. Chr.) bis zur nachbyzantinischen Epoche.
Die Ausstellung ist in fünf Einheiten unterteilt und mit reichem Informationsmaterial ergänzt.
Die erste Einheit ist der historischen und archäologischen Identität von Thesprotia gewidmet und beinhaltet Informationen über die großen Antiken Städte, wie Gitana, Elea, Elina u.a.
Es folgen die Einheiten zum Thema des öffentlichen und privaten Lebens, wo die Grabfunde aus der Gegend besonders hervorgehoben sind. Der Besucher erhält so einen verständlichen Einblick in die vielfältigen Aspekte des Lebens im antiken Thesprotia.
In den Museumssälen sind verschiedene Arten von Funden zu bewundern, wie etwa Schmuck, Gefäße, Werkzeuge, Münzen und Waffen.
Das Archäologische Museum von Igoumenitsa spielt eine wichtige Rolle im kulturellen Leben der Stadt, da es eine vielfältige Reihe von Veranstaltungen und Bildungsprogrammen organisiert.