Construido en la segunda mitad del siglo XV por el pachá Faik. La mezquita se construyó con materiales de la antigua iglesia bizantina del Consuelo, de la antigua Nicópolis y de diferentes edificaciones de Ambracia.
El pachá Faik, que quería que su nombre quedara para la posteridad, decidió construir un imaret (hospicio) en el que encontraba techo y alimento buena parte de los habitantes pobres. A causa del imaret, el barrio tomó el nombre de «Marati».
La mezquita fue escenario de batallas durante la Revolución de 1821.
Según el general Ioannis Makriyanis, el 14 de noviembre de 1821 el gran general Markos Botsaris asedió la mezquita con 300 hombres. Junto a él se presentaron varios caciques, entre ellos el héroe de la revolución Georgios Karaiskakis.
El día 15 los turcos comenzaron un bombardeo intensivo que causó grandes pérdidas. Botsaris y Karaiskakis se atrincheraron en la mezquita hasta que apareció Notis Botsaris con 300 hombres y entre todos expulsaron a los turcos hacia Arta.
Tras la liberación de Arta, la mezquita se transformó en iglesia dedicada a san Juan Ruso.
