À l’intérieur des murs paléochrétiens, quatre basiliques ont été localisées et partiellement dégagées.
La Basilique B (Basilique d’Alkison) est la cathédrale de Nicopolis et se trouve dans la partie nord de la ville. Elle remonte au milieu du Ve siècle.
Cette grande basilique à cinq nefs possède des dépendances au sud-ouest et une galerie monumentale le long de sa partie ouest. Au milieu de la nef centrale, la chaire est partiellement conservée.
Les reliefs architecturaux, dont une grande partie sont des réemplois de monuments romains, sont un trait caractéristique de la décoration intérieure de la basilique.
Les sols étaient décorés de marbres présentant une variété de dessins, tandis que des mosaïques ornaient le narthex, l’atrium et les dépendances.
