Εντός των παλαιοχριστιανικών τειχών έχουν εντοπισθεί και εν μέρει ανασκαφεί, τέσσερεις συνολικά βασιλικές.
Η Βασιλική Β (Αλκίσωνος), ο μητροπολιτικός ναός της Νικόπολης, βρίσκεται στο βορειοανατολικό τμήμα της πόλης και χρονολογείται στα μέσα του 5ου αιώνα. Πρόκειται για μεγάλων διαστάσεων πεντάκλιτη βασιλική, με βοηθητικά προσκτίσματα στα νοτιοδυτικά και επιμήκη μνημειακή στοά στο δυτικό τμήμα της. Στο μέσον περίπου του κεντρικού κλίτους διατηρείται αποσπασματικά ο άμβωνας.
Χαρακτηριστικό στοιχείο του εσωτερικού διακόσμου της βασιλικής αποτελούν τα ανάγλυφα αρχιτεκτονικά μέλη, μεγάλο ποσοστό των οποίων αποτελούν spolia ρωμαϊκών μνημείων. Τα δάπεδα κοσμούνταν με μαρμαροθετήματα σε ποικίλα σχέδια, ενώ ψηφιδωτά κοσμούσαν το νάρθηκα, το τρίστωο αίθριο και χώρους των προσκτισμάτων.