Возведен Фаик-пашой во второй половине XV в. Мечеть была построена из материалов старой византийской церкви Богоматери-Утешительницы, а также материалов из древнего Никополя и различных древних зданий Амбракии.
Фаик-паша, желая обессмертить свое имя, решил построить Имарет (богадельню), который предоставлял приют и пищу большому количеству бедных людей. От Имарета произошло и название района — «Марати».
Мечеть являлась местом сражений во время революции 1821 г.
Согласно Иоаннису Макрияннису, 14 ноября 1821 г. Маркос Ботсарис с 300 мужами забаррикадировались в мечети. К нему присоединились многие военачальники нерегулярной армии, среди которых был и Георгиос Караискакис.
15 числа турки начали непрерывную канонаду, что вызвало значительные потери. Ботсарис и Караискакис укрылись в мечети, пока не появился Нотис Ботсарис с 300 солдатами, после чего общими усилиями они отодвинули турецкие войска по направлению к Арте.
После освобождения Арты мечеть была преобразована в церковь, посвященную святому Иоанну Русскому.